I 2014 blev Jeppe Kofod valgt til Europa-Parlamentet, hvor han repræsenterede Socialdemokratiet indtil 20191. Han var medlem af Gruppen for Det Progressive Forbund af Socialdemokrater (S&D) og arbejdede med emner som energi, klima og udenrigspolitik. Han var også næstformand for S&D-gruppen fra 2016.